太子为了替其老师高允开脱，决定和高允一起觐见太武帝，并再三嘱咐他：“至尊如有询问，你尽管顺着我的话说。”待见到太武帝，太子首先奏道：“高允在臣宫，相处多年，为人小心谨慎。他虽与崔浩同撰《国记》，但损益褒贬，均系崔浩总裁。”高允没等太子将话说完，马上据实承担了责任。太武帝大怒，决定立斩高允。太子又急忙解释道：“高允这是惧怕父皇天威，一时惊慌失措，语无伦次。儿臣曾私下问过他事实真相，他已承认全系崔浩所为。”高允一听，连连摇头，再三表示：这是太子哀怜他，为他乞命；事实上，太子从未问过他，他也从未说过那样的话。还强调说：“臣罪该万死，不敢妄言！”太武帝见他如此勇于承担罪责，不由得动了心，感叹道：“临死不移诚实之性，人之所难；宁死不欺君卖友，不愧忠贞之道。应赦其罪。”随后，命高允起草诏书：自崔浩以下，僮吏以上，百二十八人皆夷五族。但高允却“持疑不为”，又冒死为崔浩争辩。最后，经太子反复说情，只杀了崔浩及其姻亲族人，其他人仅自己被处死，家人、亲人、族人免于死罪。高允对太子说：“我原是东野的一个平凡书生，本来就没有做官的打算，巧遇太平盛世，才脱下粗布衣服，官位显荣而尸位素餐，妨碍贤能之人已经很久了。崔浩几代受到特殊礼遇，却辜负皇帝的恩德，私欲淹没了他的公正廉洁和立场原则，他今日受到惩处当然是咎由自取。但是对崔浩如实记载皇帝的言行事迹，谈论国家的施政得失，却得修史的原则，不应扣上过多的罪名。《国记》一事，确实是我跟崔浩共同完成的，生死荣辱，在道理上不应该有区别。但是承蒙殿下的恩德，让我苟且偷生，这不是我的心愿。”太子对高允公正无私的品德非常钦佩，连声称赞。
多年后，太武帝与人谈及此事，还颇为感慨地说：当初，假如没有高允力争，要多死数千人。高允冒死进谏，功不可没。
3、德高望重，待人宽和
高允自太武帝至孝文帝，出入三省，参与枢密五十多年。太武帝与他同定律令，共商朝政；文成帝对他礼敬更甚，不呼其名，而尊称“令公”。高允到了暮年，仍时时处处想着他人。高允虽然德高望重，又深得皇帝恩宠，可他从来不摆架子以势压人。
有一次，孝文帝到西郊祭天，命令用宫廷马车迎接年老的高允到郊外离宫观摩，不料途中马受惊狂奔，造成人仰车翻，使他面部三处受伤。孝文帝大怒，决定将驾车人先打四十大板，然后斩首示众。高允知道后，力言无恙，再三说明小伤无碍，再三恳请孝文帝免去驾车人的罪。孝文帝看在老臣的面子上，只好收回成命。
此后不久，孝文帝命令中黄门苏兴寿照顾高允，当苏兴寿搀扶着高允在雪地行走时，突然蹿出了一条狗，把高允惊倒在地。苏兴寿害怕皇帝怪罪，顿时吓得嘴唇发青，浑身打战，而高允却一再安慰他，还让周围的人不要将此事传出去。苏兴寿对此非常感动，称誉高允说，同他共事三年，从未见到他发怒过。
对于有困难的人，哪怕是罪人的亲属，高允也给予帮助。有一位名叫窦瑾的大臣，因犯罪被杀，他的儿子逃到山里隐藏起来，他的妻子焦氏年老无依无靠，无人赡养，窦瑾昔日的亲朋故友，唯恐受到连累，谁也不肯救助她。高允听说后，立即派人悄悄将焦氏接回自己家中，并养护她六年之久。
4、操守刚劲，自奉清廉
在北魏官场上，贪污腐化之风盛行，一些官吏以权谋私，搜刮民财。而高允却不随波逐流，出淤泥而不染，自奉清廉。在他官拜中书令时，虽蒙皇宠，却依然“家贫布衣”。他常常让儿子们上山打柴，靠卖柴的微薄收入养活全家。一天，司徒陆丽对文成帝说：“高允虽承蒙皇上宠爱礼遇，但家中却一贫如洗。妻子儿女们也没有固定的生活来源，有时米罐空空，连饭都吃不上。”文成帝不信，当天就亲临高允家，见其家只有几间茅草房子，几条破棉被，家人穿的棉袍里面塞的竟然是乱麻丝，厨房的灶台上仅有一点咸菜而已。文成帝内心深受触动，感叹没有比高允再清贫的了，说：“古代所谓清贫之人，竟至于此乎！”于是，一回宫便下令立即赐给他五百匹帛，千斛粟。但是，高允却坚决推辞，不肯接受。
高允曾多次以年迈为由，奏请还乡，文成帝始终没有同意，准他乘车入殿，朝贺不拜。高允晚年病重时，孝文帝派御医给他看病，并赏给他皇上享用的各种精美食品，从酒、肉、粮到床帐、衣服等，把庭院堆得满满的。高允上表感谢皇恩，将物品都分给了下属和故旧，没过几天就去世了，享年九十八岁，这在历代名臣中，是少有的高寿。在北魏长达50多年的官宦生涯中，高允将汉族的许多知识、观念和制度传授给了这个游牧民族，促进了北魏政治、经济和文化等方面的发展。他操守刚劲，为官一生，一介不取，至死节操不移，以一种超凡脱俗的豁达人生态度忠君爱民，赢得了五位皇帝的信任和尊重。
心中无我，唯有他人最为念；无欲无求，粗茶淡饭自心安。不为贫贱困苦所扰，不为名利权位所缚，高允的直节劲气源自心境澄明，无所求，也无所惧，这就是清官的境界。